内切酶常用指南「友名生物」
一般是以微生物属名的第yi个字母和种名的前两个字母组成,第四个字母表示菌株品系。例如,从bacillus amylolique faciens h中提取的---性内切酶称为bam h,在同一品系---中得到的识别不同碱基顺序的几种不同特---的酶,可以编成不同的号,如hindⅱ、hindⅲ,hpai、hpaⅱ,mboi、mboⅱ等。
别名:restriction endonuclease简称---酶
酶反应:---性内切酶能分裂dna分子在一限定数目的专一部位上。它能识别外源dna并将其降解。
单位定义:在指明ph与37℃,在0.05ml反应混合物中,1小时---1μg的λdna的酶量为1单位。
性状制品不含非专一的-水解酶由10单位内切酶与1μg λdna,保温16小时所得的凝胶电泳图谱的稳定性表示,这类酶主要是从原核生物中分离出来的,迄今已经从近300多种不同的微生物中分离出约4000种---酶。
质粒载体和外源dna中---酶切位点的性质
如今,质粒载体中---酶切位点的种类---繁多,因而通常都有可能找到某种带---酶切位点恰恰与外源dna部分片段本身-二致的载体。这就具备一个不可1比拟的优点,也应是可以用相应的---酶---重组质粒崦回收外源dna。另一种方案,则是把片段插入到载体中能产生匹配末端的任何位点中。例如,识别不同的六核苷酸的---酶bamhl和bglⅱ产生具有相同---末端的---酶切片段,这样用bglⅱ---而制备的外源dna部分片段可以克1隆到用banhl---的质粒中。这通常会使接合序列不能被曾用于外源dna或制备载体的任何一种酶所切开。然而很多清况下,用切点位于多克1隆序列侧翼的---酶进行---,可将片段从重组质粒中摘出。偶尔在质粒的以及外源dna两端的---酶切位点之间,不可能找到“门当户对”的搭配关系。这时可用下面两种方案加以解决:
1在线状质粒末端和或外源dna部分片段的末端接上合成在接头或衔接头。
2在得到控制的反应条件下,用大肠杆1菌dna聚合酶i klenow片段部分补平带3凹端的dna部分片段。如第九章所讨论,这样常可以使那些不相匹配的---酶切位点转变为互补末端,从而促进载体和外源dna的连接。因为部分补平的反应消除了同一分子两端彼此配对的能力,故连接反应过程中环化和自身寡聚化的机会也会有所降低
---性内切酶已有百余种,每种酶有其特定的核苷酸序列识别特---,酶的活性需mg+2来激1活。不同的酶也有许多差别:有些酶除需mg+2外,还需atp 等其他辅助因子的激1活;切割位点和识别序列间的距离不同;有的内切酶同时具有甲1基化作用。根据这些差别,可将---性内切酶分为i、ii 和iii 种类型。ii 型---性内切酶只需要二价镁离子的激1活,酶在其识别序列内切割双链dna,产生的各种dna部分片段具有相同的末端结构,而且大多数的ii 型酶可提供粘性未端,有利于片段再连接,大部分ii 型酶所识别的序列具有反向对称的结构,或称之回文结构。如ecori 和hindiii 的识别和切口分别为:
ecori : g ↓aatt c hindiii : a↓agct t
t tcga↑ a c ttaa↑g
---性内切酶的控制鉴定
---性内切酶的一个活性单位是指,在50μl 的反应体系里,采用随酶提供的 nebuffer,用1个小时的时间,---1μg底物dna所需要的酶量。酶切反应应在带盖的eppendorf 管中进行,选用技术-上所标明的适宜温度。在确定酶活性之前,浓缩的酶应该用的贮存液稀释成大约1,000 单位/ml。
控制
所有控制鉴定结果都公布在随酶提供的技术-上。
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