水分管理：穴盘内育苗的基质容量小，育苗盘，空隙度大，多肉育苗盘，可吸纳的水分较少，苗床对幼苗供水的缓冲性小，稍有疏忽，易产生失水现象，夏秋高温季节要在清晨和傍晚气候凉爽时及时喷洒水分。
育苗盘育苗移栽时不损伤根系，缓苗迅速，成活率高。苗木长大后，就应开始使用控根快速育苗技术，移入控根快速育苗容器内，继续生长。控根快速育苗容器是一种以调控根系生长的新型快速育苗技术，对防止根腐病和主根的盘绕有功效。
育苗盘可培育多种蔬菜苗、扦插苗、桉树苗等。
底部无孔的可以用作化蛹盘，可孵化蚕蛹、蛋白虫、面包虫、黄粉虫等。
播种：将种子点在压好穴的盘中，每穴一粒，避免漏播，发芽率偏低的种子每穴播2粒。
覆盖基质：播种后用蛭石覆盖穴盘，方法是将蛭石倒在穴盘上，用刮板从穴盘的一方刮向另一方，去掉多余的蛭石，覆盖蛭石不要过厚，与格室相平为宜。
用穴盘育苗种苗起苗移栽简捷、方便，不损伤根系，定植成活率高，缓苗 期短。
穴盘苗便于存放，辣椒育苗盘，运输。
播瓜类等大粒种子的穴孔基质不可太满；
避免挤压基质，否则会影响基质的透气性和干燥速度，而且由于基质压得过紧，种子会反弹，导致种子终发芽时深浅不一。
穴盘的---
现阶段的穴盘---在3-5厘米左右，西瓜育苗盘，穴盘---越深，越有利于根系生长和水分的吸收，其根系长得越好，缺点就是需要的基质会多一点。现在市场上也出现了苗木的加深穴盘，其---达到了9-11厘米，对于大苗培育的品种可以使用，例如草莓苗等。
孔穴的形状
穴盘孔穴的形状主要有圆形和方形。对于相同规格的穴盘，方形孔穴的容量，水分分布均匀，根系生长---。但因为方形孔穴容易在棱角形成死角，根系盘根不佳，从孔洞伸出，虽然圆形孔穴容量较小，但其具有---的盘根特性，因此在选择上需要充分考虑。
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