蛋白质双向电泳实验流程
1.-yi酸-bing酮沉淀法提取蛋白
2.双向电泳分离待测样品
(1)一相等电-前处理按照所用仪器的厂商提供操作手册进行。蛋白质上样浓度不要超过10mg/ml,否则会造成蛋白质的-或沉淀。
(2)等电-完毕后(约需24hr,若不立即进行第二相电泳,胶条可夹在两层塑料薄膜中于-70℃保存数月。
(3)等电-好的胶条按厂商提供的操作手册平衡两次。平衡完毕后,于电泳仪上用12.5%sds-page凝胶进行电泳分离。仪器设置为2.5w/胶 45min,15w/胶 5-8hr,20℃。
3.银染法对凝胶进行染色
(1)固定(2)清洗(3)增敏(4)清洗(5)染色(6)清洗(7)显影(8)定影(9)水洗
3.凝胶扫描及图像分析
(1)图像扫描:凝胶染色后采用image scanner以300dpi,16-bit模式65536灰阶进行扫描。
(2)图像分析:扫描完毕后,凝胶继续置于1%yi酸中于4℃保存。扫描后的图像用imagemaster 2d platinum software软件进行分析。分析按照软件厂商提供的说明书进行。以zui小点面积30,平滑度2为主要参数zui大限度检测蛋白质点。以目标蛋白质3个重复具有相同趋势,目标蛋白质相邻位点的相对一致性,至少2个重复有2倍以上差异作为判定差异表达蛋白质的标准。
5.长可以合成多长的引物?
答:引物越长,出现问题的概率就越大。有的公司合成过120base的引物,产率很低。除非需要,建议合成片段长度不要超过80mer,按照目前的引物合-率,80mer的粗产品,全长还不一定正确引物的百分比不会超过40%,pcr,后续处理还有丢失很多,的产量很低。
6.需要合成多少od数?
答:根据实验目的确定。一般pcr扩增,2 od引物,可以做200-500次50ul标准pcr反应。如果是做基因拼接或退火后做连接,1 od就足够了。但是有些研究人员,就做几次pcr,但是却要5-10 od。做全基因构建的引物都比较长,但是我们有些研究人员也要求高od数。片段越长, 全长得率就越低,出错的几率就越大。超出需要之外的od数要求,其实也是对社会资源的一种浪费,苏州pcr,同时也从一个侧面反映了部分研究人员-是新手的自信心不足,总觉得需要重复多次才能成功。
str检测
短串联重复(short tandem repeats, str),又称微wei星dna(microsatellite dna)或简单重复序列(- repeat sequence, srs或ssr),是广泛存在于原核生物和真核生物基因组中的核苷酸重复序列。有丝分裂过程中dna链之间的错配引起的fu制滑动被认为是导致str产生的较为常见原因,并且依据不同fu制单元大小的不同以及不同物种之间,fu制滑动发生的概率也不相同。
str是以序列 (core repeat units) 首尾相连多次重复形成。每个str的序列结构相同,长度为2-6bp,但其重复单位数目和重复区域的长度不同,因此str在不同种族、不同人群之间的分布具有差-,构成了str遗传多态性。不同个体之间在一个同源str位点的重复次数也不同,因而同指纹识别一样,str位点分析也可对个体进行身份识别。通过识别个体基因组在特定位点的特定序列重复,实时荧光定量pcr,即可创建其基因档案。基于此,str分析法已经成为一种重要的鉴定分析方法,应用于-学、qin子鉴定及细胞鉴定等领域。
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