目前已有多种方法可以将寡核苷酸或短肽固定到固相支持物上。这些方法总体上有两种，即原位合成 in situ synthesis 与合成点样两种。支持物有多种如玻璃片、硅片、聚膜、纤维素膜、尼龙膜等，但需经特殊处理。作原位合成的支持物在聚合反应前要先使其表面衍生出-或-视所要固定基因芯片的分子为-或寡肽而定并与保护基建立共价连接；作点样用的支持物为使其表面带上正电荷以吸附带负电荷的探针分子，通常需包被以--或多聚赖氨酸等。
目前， 在医学研究中 ， 数据分析方法在总体-为两大类:无监控集簇分析和有监控集簇分析。前者比较单纯的从数学角度按照基因表达的相似性将基因分组 ，替代肖特玻片产品， 这有助于发现新的目的基因或提供新的-信息 ， 如新的分型 、 影响预后的因素等。后者需要结合现有的知识进行分析， 适用于-归类。这对于传统诊断手段是一个有益的补充。
另外，为什么替代肖特玻片， 在目前进行的许多微阵列芯片研究中，每次研究的基因数目很大 ， 而参与实验的样本量较少。这一现象不利于得到稳定的和具有-可重复性的实验结果。
1.简易芯片
制作简易芯片时，使用机械臂把大量已知或未知序列的dn-段点在--张很小的玻璃片(通常为2cmx2cm)或尼龙膜上，再经过物理吸附作用达到固定化(cdna 芯片)。也可以直接在玻璃板表面进行化学合成，替代肖特玻片，从而得到寡聚核苷酸芯片。将芯片与待研究的edna或其他样品杂交，什么是替代肖特玻片，经过计算机扫描和数据处理，便可以观察到-的基因群在不同组织、同一组织不同发育时期或不同生理条件下的表达基因调控情况。简易芯片一般的基因数量少(一般不超过2000)，主要用于研究小部分特定基因的表达状态。简易芯片一般可以用于手工制作或者机械手点样。
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