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一般情况下,灯丝f与接收极t之间的电压为70伏,所有的标准质谱图都是在70ev下做出的。在70ev电子碰撞作用下,有机物分子可能被打掉一个电子形成分子离子，也可能会发生化学键的断裂形成碎片离子。由分子离子可以确定化合物分子量,由碎片离子可以得到化合物的结构。

对于一些不稳定的化合物,在70ev的电子轰击下很难得到分子离子。为了得到分子量，可以采用1020ev的电子能量，不过此时仪器灵敏度将大-低，需要加大样品的进样量。而且，得到的质谱图不再是标准质谱图。

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离子源中进行的电离过程是很复杂的过程，有专门的理论对这些过程进行解释和描述。

在电子轰击下，样品分子可能有四种不同途径形成离子：

样品分子被打掉一个电子形成分子离子。

分子离子进一步发生化学键断裂形成碎片离子。

分子离子发生结构重排形成重排离子。

通过分子离子反应生成加合离子。

ya气在电离室依靠放电产生ya离子，高能ya离子经电荷交换得到高能ya原子流，ya原子打在样品上产生样品离子。样品置于涂有底物如甘油的靶上。靶材为铜，原子ya打在样品上使其电离后进入真空，并在电场作用下进入分析器。

电离过程中不必加热气化，因此适合于分析大分子量、难气化、热稳定性差的样品。例如肽类、低聚糖、天然抗生1素、有机金属络合物等。fab源得到的质谱不仅有较强的准分子离子峰，而且有较丰富的结构信息。但是，它与ei源得到的质谱图很不相同。其一是它的分子量信息不是分子离子峰m，而往往是m+h+或m+na+等准分子离子峰；其二是碎片峰比ei谱要少。

esi是近年来出现的一种新的电离方式。它主要应用于液相色谱-质谱联用仪。它既作为液相色谱和质谱仪之间的接口装置，同时又是电离装置。

它的主要部件是一个多层套管组成的电喷雾喷咀。zui内层是液相色谱流出物，外层是喷射气，喷射气常采用大流量的氮气，其作用是使喷出的液体容易分散成微滴。另外，在喷嘴的斜前方还有一个补助气喷咀，补助气的作用是使微滴的溶剂快速蒸发。在微滴蒸发过程中表面电荷密度逐渐增大，当增大到某个临界值时，离子就可以从表面蒸发出来。

离子产生后，借助于喷咀与锥孔之间的电压，穿过取样孔进入分析器