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沉水植物对营养盐的吸收和钝化抑制上行效应对浮游植物的促进作用，降低水华暴发的可能性。另外，沉水植物群落结构促进肉食性鱼类生长，---生态系统中下行效应的发挥，即肉食性鱼类捕食草食性鱼类、浮游生物鱼类，优化鱼类种群结构，降低沉水植物、浮游动物被大量捕食的压力，达到控制浮游植物的效果(图2)。湖泊生态系统上行效应(通过营养盐)-下行效应(通过摄食)和其他效应模式
影响沉水植物恢复的因子
藻类的---
富营养化湖泊的初级生产力通常以浮游植物为主，呈现浊水态。藻类的遮阴效应、营养盐和无机盐的竞争作用会阻碍沉水植物的生长以及在水域中的空间分布。
在环境变化和人类活动的影响下，我国大部分湖泊生态环境恶化，沉水植物的分布面积萎缩，群落结构趋向单一化。沉水植物的消失，使生态系统中食物链变短，食物网简化，物种多样性降低，从而使整个生态系统变得较为脆弱。
近年来，湖泊富营养化问题受到了全湖沼及环境学的广泛关注。随着人类活动对湖泊生态系统影响的加剧，湖泊大型水生植物逐渐减少，甚至消失。恢复大型水生植被成为富营养化浅水湖泊生态修复的主要内容之一，是近年来水体修复生态技术研究的-之一(种云霄，2003 )。
研究表明，苦草、黑藻、金鱼藻、伊乐藻、狐尾藻、菹草均能有效去除水体中的氮、磷等营养盐含量,其中以苦草效果好。
金鱼藻、伊乐藻、眼子菜、狐尾藻、苦草等沉水植物通过叶片吸收等方式，对水体中总磷具有较好的去除效果，尤其在春季和秋季，金鱼藻对水体中总磷的去除率---92.00%，且对总溶解性磷的去除率也---90.93%。在太湖梅梁湾的生态修复工程区中，沉水植物的根系吸收作用和化学反应促进作用使沉积物总氮、总磷营养盐分别由修复前(2003年)的7043、1370mg/kg降低至2929、352mg/kg。
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