实时荧光定量PCR-「在线咨询」
分子实验介绍——荧光定量pcr检测
荧光定量pcr是检测生物样品中rna含量的普遍的方法,通过荧光染料或荧光标记的特-的探针,对pcr产物进行标记-,实时在线监控反应过程,结合相应的软件可以对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度。目前主要使用sybr green和taqman法对rna含量进行检测。sybr green在低样本量时成本较低,目前选用的较多。(2)等电-完毕后(约需24hr,若不立即进行第二相电泳,胶条可夹在两层塑料薄膜中于-70℃保存数月。
sybr green i是一种只与dna双链结合的荧光染料。当它与dna双链结合时,发出荧光;从dna双链上释放出来时,荧光信号急剧减弱。因此,在一个体系内,其信号强度代表了双链dna分子的数量。sybr green荧光染料-量pcr的基本过程是:1、开始反应,当sybr green染料与dna双链结合时发出荧光。2、dna变性时,sybr green染料释放出来,荧光急剧减少。3、在聚合延伸过程中,引物退火并形成pcr产物。除了文中提到了三个主流平台,外显子组捕获方面的新产品也在不断推出,研究人员的选择也将更广泛。4、聚合完成后,sybr green染料与双链产物结合,定量pcr系统检测到荧光的净增量加大。
实验流程:细胞或组织rna提取-rna浓度检测-rna逆转录-定量pcr检测。
结果示例:
图 a 基因扩增曲线图;b 基因扩增溶解曲线图;c mrna相对表达量变化
从图中可以扩增曲线可以看出目的rna扩增效果,溶解曲线可以看出引物识别特-情况,通过使用δδct方法计算可以得到每个组中目的mrna表达变化。
腺-包装原理介绍
腺-是一种没有包膜的直径为79-90nm的颗粒,由252个 壳粒呈二十面体排列构成。每个壳粒的直径为7-9nm。衣壳里是线状双链dna分子,两端各有长约100bp的反向重复序列。据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个snp,无论是比较于度多态性(rflp)分析还是微标记(str),都要广泛得多。人体腺- 已知有33种,分别命名为ad1-ad33,研究详细得是ad2.
腺-是一种无包膜的球型结构的-,遗传物质为线型 双股dna形式。腺-的特点:1gan染范围广对人致病性低;2对增殖和非增殖细胞均具有gan染性;3能有效进行增殖;不同个体之间在一个同源str位点的重复次数也不同,因而同指纹识别一样,str位点分析也可对个体进行身份识别。 4-滴度高;5不整合到染色体中,无插入致突变性;(6)外源基因装载容量大。由于腺-的这些特点使其广泛地应用于体 外基因转导、体内接种yi苗、和基因zhi疗等各个领域。
实验方法
1.获得目的基因序列;
2.构建-表达载体质粒;
3.表达载体质粒和包装质粒重组;
4.gan染hek293,包装出-;
5.-扩增、浓缩;
6.滴度测定。
聚合酶链式反应(pcr)
操作步骤
1.在冰浴中,按以下次序将各成分加入一无菌0.5ml离心管中。
1qpcr buffer
5 μl
dntp mix( 2mm )
4 μl
引物1(10pm)
μl 2
引物2 ( 10pm)
2μl
taq酶(2u/ul)
1 μl
dna模板( 50ng-1μg/μl )
加ddh2o至
μl 50
视pcr仪有无热盖,不加或添加石蜡油。
2.调整好反应程序。将上述混合液稍加离心,立即置pcr仪上执行扩增。-般:在93°c
预变性3-5min ,进入循环扩增阶段: 93°c 40s***58°c 30s***72°c 60s ,循环30-35
次,后在72°c保温7min。
3.结束反应, pcr产物放置于4°c待电泳检测或-20°c长期保存。
4. pcr的电泳检测:如在反应管中加有石蜡油,需用100ul进行抽提反应混合液,以
除去石蜡油;否则,直接取5- 10μl电泳检测。
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