实时荧光定量PCR细胞分离培养「在线咨询」
rna提取
1.弃去培养液,用pbs清洗两次1-2。
2.弃去pbs,用1000u1吸干净残余pbs。
3.加1ml trizol研磨b 41。
4. 1.5miep管标号与每孔相对应备用。
5.研磨好的溶液转移至对应的 ep管中国。
6.往每个ep管中加入250ul,剧烈震荡30s, 冰上静置12min[问l。
7. 所有样品4c离心,转速: 13500转1分钟,时间: 15min.
8. 再次标记一批同样编号ep管。
9.离心后吸上清液400u1移入相应编号的ep管中,再加入400ul异充
分混匀。4c冰箱35min。
10. 4c离心,转速: 13500转1分钟,时间: 10min.
11.弃去.上清液,加1m175%---,轻摇7]。
12. 4c离心,10600转/分钟,时间: 5min.
13. 弃上清液滤纸吸干。
14. 加depc水10ul溶解,-80c保存。进行逆转录前测浓度。
组织rna提取
1、剪米粒大小组织块放入ep管中标号。
2、ep管中加300ul trizol浸泡30分钟或更久。
3、用研磨棒研磨,以肉眼很难看到组织为宜。
4、加700u1 trizol静 置5分钟。
microrna芯片:
rna干扰(rna interference, rnai)现象是一种进化上保守的抵御或外来---qin犯的防御机制。将含有靶基因mrna同源互补序列的rnadouble strand rna, dsrna导入细胞后,能够特异地识别该mrna,引起mrna的降解,从而导致相应的功能缺失。于台式离心机以12000rpm离心5min,取上清液入另一离心管中。rnai提供了一种经济、快捷、gao效的抑制特异基因表达的技术手段,该技术已被广泛用于研究基因功能和chuan染性---及恶xingzhong瘤基因zhi疗领域。目前常用的rna干扰手段为mirna、 shrna和sirna等。
mirna是一类可以通过rnai机制调节基因表达的内源性小rna,人工mirna与shrna的设计原理基本相同,由于mirna具有内源性,因此其更易产生有效的基因沉默。
技术流程:
dsrna或pre-mirna被导入细胞后,能够被一种特异的-内切酶dicer识别并切割成为小片段,这些片段在rna解旋酶的作用下解链。继之反义链在与体内一些酶包括内切酶、外切酶、解旋酶等结合形成rna-的沉默复合物rna-induced silencing complex,risc,risc与mrna同源区进行特---结合,若mirna与mrna的结合位点配对,则切割mrna;若mirna与mrna的结合位点不配对,则抑制mrna的翻译。在同样获得80m测序数据的情况下,nimblegen有97%的目标序列达到10x以上的测序---,而其他产品只有90%。
逆转录---构建及包装
逆转录---retrovirus是一类rna---。在逆转录酶的作用下,以---rna为模板合成cdna再通过dna、转录、翻译等过程形成---颗粒。逆转录---表达系统是一种新的重组蛋白表达系统,由逆转录---载体、辅助载体表达---包装需要的蛋白质和包装细胞系组成。线粒体测序线粒体是真核生物的重要细胞器,是生物体的能量工厂,参与能量代谢、信号转导、细胞凋亡等许多生命活动,对生物的生理活动起着---的作用。逆转录---载体在外源基因表达、基因沉默、、生物制药等得到广泛的应用。逆转录---载体主要优点:转染范围广,可以各种细胞类型,转入的外源基因可完全融合,对细胞率高,细胞不产生病变,可建立细胞系长期持续表达外源基因。
逆转录---载体系统共有两部分组成:包装细胞系和缺陷---本身。在逆转录---载体中,去除了正常的蛋白编码序列而保留了和包装信号,通过分子技术将目的基因插入此载体上,而包装细胞系能提供---载体包装成---粒子所需的结构蛋白。逆转录---载体主要优点:转染范围广,可以各种细胞类型,转入的外源基因可完全融合,对细胞率高,细胞不产生病变,可建立细胞系长期持续表达外源基因。当重组---载体导入包装细胞后,缺陷---载体和包装细胞的互补作用共同完成---装配,该---颗粒可其它宿主细胞,此时目的基因进入该细胞并整合到细胞基因组中,导致插入序列在宿主细胞中表达,产生目的蛋白。宿主细胞不能像包装细胞那样为缺失结构基因的逆转录---提供结构蛋白,因而在宿主细胞内不会产生新的毒颗粒,---了该载体在生物制品领域的生物安全性问题。
二、操作步骤:
1. 所有在纯化系统里使用的溶液当日都需要经过 0.22μm 的滤膜抽滤、脱气处理;保存 4℃ 冰箱里的缓冲液若要在室温使用需恢复至室温后抽滤脱气;
2. 样品上柱纯化前,需先滤膜过滤,少量样品可用离心13000rpm,10min;
3. 依次用水、缓冲液洗泵;设置流速和柱前警报压压力值参阅层析柱及填料说明书,取较小的一个大耐受压力。防止柱中进入气泡,影响分离效果;
4. 当柱子限压在 0.3mpa,或者在限压状态---速很低时,ph valve 中的 restirtor 可以切换成 off line,即显示 by-pass 状态;
5. 当需要通过仪器上样环上样时,将 w1 阀口处换成带透明短软管的阀门,从此处阀门位通过倒吸样品上样;
6. 进样阀「inject」为上样状态。上样结束可将进样阀切换回「load」状态。并用纯水认真清洗上样环至少 3 次;将 w1 阀口处换回原来接头阀门。
7. 纯化结束后,用纯水清洗泵和平衡柱子;再用 20% 的---清洗泵以及系统。长期不用,层析柱应保存在 20% 的---中,泵放置在 20% ---中;
8. 实验结束后及时倾倒废液瓶里的废液;
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