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载气系统包括气源、气体净化器、气路控制系统。载气是气相色谱过程的流动相，原则上说只要没有腐蚀性，且不干扰样品分析的气体都可以作载气。常用的有h2、he、n2、ar 等。在实际应用中载气的选择主要是根据检测器的特性来决定，同时考虑色谱柱的分离效能和分析时间。载气的纯度、流速对色谱柱的分离效能、检测器的灵敏度均有很大影响，气路控制系统的作用就是将载气及辅助气进行稳压、稳流及净化，以满足气相色谱分析的要求。选择气体纯度时，主要取决于分析对象、色谱柱中填充物以及检测器，尽可能选用纯度较高的气体。这样不但会提高保持仪器的高灵敏度，而且会延长色谱柱和整台仪器气路控制部件，气体过滤器的寿命。实践证明，作为中仪器，长期使用较低纯度的气体气源，一旦要求分析低浓度的样品时，要想恢复仪器的高灵敏度有时十分困难。对于低档仪器，作常量或半微量分析，选用高纯度的气体，不但增加了运行成本，有时还增加了气路的复杂性，更容易出现漏气或其他的问题而影响仪器的正常操作。
检测器的功能是对柱后已被分离的组分的信息转变为便于记录的电信号，然后对各组分的组成和含量进行鉴定和测量，是色谱仪的眼睛。原则上，被测组分和载气在性质上的任何差异都可以作为设计检测器的依据，但在实际中常用的检测器只有几种，它们结构简单，使用方便，具有通用性或选择性。检测器的选择要依据分析对象和目的来确定。
数据处理系统目前多采用配备操作软件包的工作站，用计算机控制，既可以对色谱数据进行自动处理，又可对色谱系统的参数进行自动控制。
气路系统：包括气源、气体净化、气体流速控制阀门和压力表等。
进样系统：包括进样器、汽化室将液体样品瞬间汽化为蒸气等。
分离系统：包括色谱柱和柱温控制装置色谱柱箱等。
检测系统：包括检测器，控温装置等。
操作系统：包括中文显示器、触摸式参数输入键盘。
记录系统：包括放大器、数据处理系统色谱工作站等。
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