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lncrna芯片
long non-coding rnaslncrnas是一类转录本长度超过200 nt的功能性非编码rna分子。目前的研究已证实,lncrna参与x染色体沉默,基因组印记以及染色质修饰,转录ji活,转录干扰,核内运输等多种重要调控过程。结束反应,pcr产物放置于4°c待电泳检测或-20°c长期保存。随着对lncrna在哺乳动物进化及人类-发生和发展中作用的日益关注,lncrna调控机制已成为当前遗传学研究的-问题。
筛选出差异表达的lncrna是研究其在人类-发生中所扮演角色的基础。富衡生物为用户提供高通量的lncrna芯片进行lncrna表达谱分析,该芯片基于agilent的sureprint技术生产,实验。
技术优势
信息覆盖广泛:覆盖了多个quan威lncrna数据库发布的数据;提供人,小鼠,大鼠的lncrna检测。
lncrna和mrna同时检测:芯片上包含有的lncrna和新的mrna序列检测探针。一次芯片实验可同时对lncrna和mrna进行分析。
平台成熟-:采用agilent原位喷墨合成技术,了高检测灵敏度和特-。
数据分析:提供lncrna和mrna表达谱差异分析和功能分析,以及二者的关联分析。
蛋白提取
大部分蛋白质都可溶于水、稀盐、稀酸或碱溶液, 少数与脂类结合的蛋白质则溶于-、-等有ji溶剂中,因些,可 采用不同溶剂提取分离和纯化蛋白质及酶。
(一)水溶液提取法
稀盐和缓冲系统的水溶液对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质常用的溶剂,通常用量是原材料体积的1-5倍,提取时需要均匀的搅拌,以利于蛋白质的溶解。提取的温度要视有效成份性质而定。此外,illumina还捕获了未翻译的区域,这是nimblegen和安捷伦平台无法靶定的。一方面,多数蛋白质的溶解度随着温度的升高而增大,因此,温度-于溶 解,缩短提取时间。但另一方面. ,温度升高会使蛋白质变性失活,因此,基于这一点考虑提取蛋白质和酶时一般采用低温( 5度以下)操作。为了避免蛋白质提以过程中的降解,可加入蛋白 水解酶抑zhi剂(如二yi--,碘yi酸等)。
22.同样的od用page检测,eb染色为什么深浅不一?
答:通常可以用eb染色的方法来判断双链dna的量(如质粒dna),因为eb可以嵌合到双链dna中。而合成的单链dna,由于碱基组成不同,形成二级结构的可能性不同,eb的染色程度也会有差异,比如oligo(dt)等不形成二级结构,eb染色效果就非常差。有丝分裂过程中dna链之间的错配引起的fu制滑动被认为是导致str产生的较为常见原因,并且依据不同fu制单元大小的不同以及不同物种之间,fu制滑动发生的概率也不相同。所以不要用eb染色的方法来定量,而用紫外分光光度计检测。同样道理,用eb染色来照片不适合所有引物。
23.引物不纯会有什么后果?
答:引物不纯可能会导致:1)非特-扩增;2)无法用预先设计在引物5′端酶切位点的酶切开,-是没有保护碱基的引物;3) 用于测序出现双峰或乱峰。解决办法重新合成或重新纯化。
24.已经溶解的引物,为什么原先使用正常,而过一段时间再使用就不好了?
答:如果溶解引物的水ph过低或污染了菌或-酶,会使引物降解。使用时没有充分解冻混合,液体不均匀也可能会造成引物加入量不准确。筛选出差异表达的lncrna是研究其在人类-发生中所扮演角色的基础。建议分装引物,避免反复冻溶。建议使用10mmt ris ph7.5缓冲液溶解引物,因为有些蒸馏水的ph值比较低ph4-5, 引物在这种条件下不稳定。还有一种可能性是引物没有问题,而是pcr使用材料-是模板的与先前使用的不完全一致。
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