北京天演融智软件有限公司为您提供primer premier pcr引物设计软件。primer premier pcr引物设计软件
标准pcr分析的引物设计
primer premier是设计和分析pcr引物的zui全面的软件。primer premier通过利用zui接近的热力学算法和zui---的熔化温度,找到zui优的pcr、多重和snp基因分型引物。引物被筛选的二级结构、二聚体、发夹、同源性和物理性质,然后报告zui佳的序列,按顺序排列。配备了一个方便的计算器,您可以很容易地操作序列并分析您的引物设计的结果。从ncbi加载感兴趣的基因,选择一个搜索范围,让primer premier为您挑选zui好的引物。
snp基因型分析的引物设计
使用primer premier,您可以从dbsnp加载序列,并将所设计的引物并置在snp选定的两侧。数百个未发表的snps也可以通过在标准genbank/ dbsnp文件中zhi定它们作为变体特性来加载。在zhi定snps之后,引物设计可以增强他们使用probe-based化学检测。
多重检测
对于多重实验,primer premier可以让您在批处理模式下启动引物搜索,然后检查设计的引物的交叉反应性,从而减少错误启动。
自动同源性和避免模板结构
primer premier自动解释blast搜索结果,并避免那些区域设计与数据库具有---交叉同源性的引物。这些同源区域在序列视图中被---显示,并且在引物搜索期间被避免了。由于在扩展温度下存在模板结构,可能会阻碍引物的扩展。为了避免所有这些区域的模板自动折叠,在您zhi定的折叠温度下,程序使用专有算法来检查模板内可能的二级结构。在序列视图中,二级结构形成的区域下面用横线强调,并在设计引物时被避免。避免同源区域使得寡聚物高度特---,避免模板结构提高设计引物的效率。
手动引物搜索
primer premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项,用户可以选择模板序列上的任何位置来设计感测或反义引物。primer premier会立即计算并显示新引物的性能。然后在主窗口的序列视图中显示由用户zui终选择的引物。
编辑模板序列
模板序列是可编辑的,可以由用户来更改。可以使用标准的剪切---粘贴来进行修改。通过使用delete按钮可以删除不需要的序列区域。用户可以---或注释一个序列并保存它们以备将来参考。
功能特征
新改进的搜索算法
自动顺序检索
自动同源和模板结构避免
评估预先设计引物
手动引物搜索
编辑模板序列
序列浏览
生成报告
本地/桌面搜索功能选项
计算器
数据/数据库管理
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