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随着基因组测序、分子生物学检测手段的快速发展,pcr和荧光定量pcr实验,正在越来越多的实验室应用。然而,pcr作为一种高灵敏度的检测手段,pcr的实验结果也容易被各种无关的外源性dna或rna所干扰。
pcr实验室中,很容易发生dna的交叉污染,污染通常来自于离心管、移液器和其他试验设备产生的dna气溶胶,或dna溶液污染桌面,或吸样枪不慎将样品或模板-吸入枪内。据估算,一个气溶胶颗粒可含48000个dna拷贝。 因此,为-pcr试验的数据准确,避免交叉污染,应定期对pcr实验室做dna污染情况的监测。
总rna的抽提方法:
目前常用的方法是用异硫qing酸胍-1酚抽提法。
提取步骤:
先用液氮研磨材料,匀浆,加入trizol试剂,进一步破碎细胞并溶解细胞成分。然后加入氯1仿抽提,离心,分离水相和有机相,收集含有rna的水相,通过-1醇沉淀,获得比较纯的总rna,用于下一步mrna的纯化。也可将含有rna样品的细胞破碎液通过硅胶膜纯化柱纯化。
rna浓度和纯度判断:
od260为1时相当于浓度为50 ug/ml;
od260/0d280值在1.8~ 2.0之间,表示纯度较好;
0d260/od280值低于1.8,样品有蛋白质或酚污染;
0d260/0d280值大于2.0,提取的rna可能有降解;
电泳后如果rrna大小完整,而且28s rrna和18srrna亮度接近2:1、mrna分布均匀,则认为rna。
pcr产物的回收胶回收试剂盒
1.胶回收的目的1去除非特-扩增的产物2去除多余的底物3去除多余的taq酶4得到目的片段
2.胶回收的过程1切胶:紫外下切胶,称重。之后用枪头将胶块捣碎。切胶的刀片建议选用-刀片,实验台等也尽可能用-擦拭干净。可通过空ep管与装胶ep管的差值计算胶的。注意切胶时尽可能避免切到条带外的凝胶,且避免紫外时间过长。别忘记胶条有厚度,前后多余的部分也尽量切除。
为什么用无水-沉淀dna
用无水-沉淀dna,这是实验中较常用的沉淀dna的方法。-的优点是可以任意比和水相混溶, -与-不会起任何化学反应,对dna很安全,因此是理想的沉淀剂。
dna溶液是dna以水合状态稳定存在,当加入-时,-会夺去dna周围的水分子,使dna失水而易于聚合。一般实验中,是加2倍体积的无水-与dna相混合,其-的zui终含量占67%左右。 因而也可改用95%-来替代无水-(因为无水-的价格远远比95%-昂贵)。
但是加95%的-使总体积增大,而dna在溶液中有一定程度的溶解,因而dna损失也增大, 尤其用多次-沉淀时,就会影响收得率。折中的做法是初次沉淀dna时可用95%-代替无水乙酵, 后面的沉淀步骤要使用无水-。也可以用0.6倍体积的-1醇选择性沉淀dna。一般在室温下放置15-30分钟即可。
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