-共沉剂来电咨询「在线咨询」
随着基因组测序、分子生物学检测手段的快速发展,pcr和荧光定量pcr实验,正在越来越多的实验室应用。然而,pcr作为一种高灵敏度的检测手段,pcr的实验结果也容易被各种无关的外源性dna或rna所干扰。
pcr实验室中,很容易发生dna的交叉污染,污染通常来自于离心管、移液器和其他试验设备产生的dna气溶胶,或dna溶液污染桌面,或吸样枪不慎将样品或模板-吸入枪内。据估算,一个气溶胶颗粒可含48000个dna拷贝。 因此,为---pcr试验的数据准确,避免交叉污染,应定期对pcr实验室做dna污染情况的监测。
从动物组织中提取基因组dna
使用研钵进行匀浆时:
取1~100 mg的动物组织或人组织移入冰浴预冷的研钵中,快速用力展研成匀浆。注下列组织请加液氮研磨至粉末状。
a.富含dna酶的胰脏、脾1脏、胸腺、淋巴等组织。
b.富含胶原蛋白的皮肤、肌腱等组织。
c.富含角质蛋白的组织或坚硬的组织如骨骼等。
加入650 μl的solution a和0.9 μl的rnase a1,温和研磨30秒钟。注使用上述-注的实验材料时,请在加入solution a及rnase a1后,将研钵置于65℃水浴上研磨1分钟。
收集650 μl研磨好的组织匀浆液移至collection tube中。如果匀浆体积不足650 μl,请补充solution a至650 μl,65℃保温5分钟。
使用研磨棒进行匀浆时:
取1~100 mg的动物组织或人组织移入冰浴预冷的collection tube 中,用研磨棒快速研磨成糊状。
加入350 μl的solution a和0.9 μl的rnase a1后用研磨棒快速研磨成匀浆。
加入350 μl的solution a将研磨棒上的匀浆冲入collection tube中,充分振荡混合后,65℃保温5分钟。
如何确认rna的
实时荧光定量pcr技术是通过测定rna的转录水平来评估基因的活力。rna样本提取的直接影响基因表达分析。影响rna品质的因素有以下三种:rna浓度、rna纯度和rna完整性。
检测rna浓度、纯度和完整性的方式主要有以下几种:
紫外分光光度计法:
测量260nm吸收值计算rna浓度,测量260nm/280nm吸收值的比值,用于评估rna纯度。需要注意的是:在检测-物质时应该在固定的ph溶液中进行。
260nm/280nm的比值范围在 1.9~2.1 之间。<1.9,说明有蛋白质残留;>2.1,说明rna可能发生降解。
琼脂糖凝胶电泳:
完整的rna通常有三条带,zui亮的是28s条带,其次是18s条带,zui淡的是5s条带部分试剂盒提取时会过滤掉5s条带。通过琼脂糖凝胶电泳可以检测28s和18s的比值。该方法主要用于检测rna的纯度和完整性。
如果28s和18s条带明亮、清晰、条带锐利,28s的亮度在18s条带的两倍以上,我们认为rna的zui好。
若rna条带出现弥散,原因可能:rna被-酶降解、电压或电流过大、上样量过高或过低等。
为什么用无水---沉淀dna
用无水---沉淀dna,这是实验中较常用的沉淀dna的方法。---的优点是可以任意比和水相混溶, ---与-不会起任何化学反应,对dna很安全,因此是理想的沉淀剂。
dna溶液是dna以水合状态稳定存在,当加入---时,---会夺去dna周围的水分子,使dna失水而易于聚合。一般实验中,是加2倍体积的无水---与dna相混合,其---的zui终含量占67%左右。 因而也可改用95%---来替代无水---(因为无水---的价格远远比95%---昂贵)。
但是加95%的---使总体积增大,而dna在溶液中有一定程度的溶解,因而dna损失也增大, 尤其用多次---沉淀时,就会影响收得率。折中的做法是初次沉淀dna时可用95%---代替无水乙酵, 后面的沉淀步骤要使用无水---。也可以用0.6倍体积的---1醇选择性沉淀dna。一般在室温下放置15-30分钟即可。
联系时请说明是在云商网上看到的此信息,谢谢!
本页网址:https://www.ynshangji.com/xw/24432286.html
声明提示:
本页信息(文字、图片等资源)由用户自行发布,若侵犯您的权益请及时联系我们,我们将迅速对信息进行核实处理。
登录后台


