GENEIOUS 分子生物学和NGS分析软件

北京天演融智软件有限公司为您提供geneious 分子生物学和ngs分析软件。ngs分析和基因组学
使用行业的算法，包括tophat和velvet，illumina、pacbio或torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析，包括基因组浏览器、---的可视化、snp调用和rna-seq表达式分析。
序列图和色谱分析
修剪、组装和查看sanger排序---文件，正确的碱基调用并创建---的序列。基因预测、模式、翻译和变异调用的自动标注。基因型微weixing---自动梯拟合和峰值调用和生成等位基因表。
对齐和树构建
使用包括mafft和clustalw在内的算法对dna或蛋白质进行成对和多种比对。查看和编辑实时翻译和---显示。使用包括raxml和paup在内的同行评审算法构建系统树，并为公开准备的图形调整显示设置。
分子---
查看质粒图，自动注释矢量并用注释---粘贴序列。寻找---站点、---、连接和执行golden gate，gibson和gateway---。设计引物，找到crispr站点并优化密码。在---过程中---历史和亲子后代谱系。
搜索、共享和自动化
针对ncbi进行批量blast，并直接搜索genbank。使用无缝集成的共享库集中和协作数据。导入和导出大多数行业标准文件格式。建立自动化的工作流程，以提率，控制业务流程，并减少您的研究中的人为错误。
geneious新功能
新的特征包括改进的火山和pca图用于表达分析，新的crispr cpf1选项和---站点的无表型突变分析。
snapgene文件导出
将snapgene*.dna序列文件拖放到geneious中，无缝地导入序列及其注释和其他元数据。
crispr-cpf1特---评分
自信地选择zui佳crispr-cpf1引导rna位点使用新的特---评分，这是根据对您选择的数据库的非目标分析计算出来的。
智能ngs导入
只需一个简单的步骤就可以将任何类型的sam、bam、gff、bed和vcf文件拖放到geneious中，即使您有不同的样品和参考序列的混合物。
crispr cpf1选项
添加了crispr-cpf1与5pam位点的支持。在a和t丰富序列中找---点，并在体内具有更高的裂解效率。
rna-seq表达分析的火山图
在交互式火山图中可视化基因表达，可以用来---和跳转到差异表达基因。
---性位点无表型突变分析
自动识别在不影响蛋白质的情况下引入---位点的编码序列中的点突变。
漂亮的pca图
具有---的标签和新的可视化选项，创建漂亮的pca图形。
创建酶制剂
不再从其他来源获取信息。现在您可以很容易地创建您自己的酶组。
---的fastq导入功能
在导入过程中，成对读取可以相互关联，而geneious会猜出它们是如何配对的。还可以设置读取技术。
为---基因组比对更新mauve插件
现在包括对序列列表的支持和用于重新排序重叠群的mcm操作，使draft基因组对齐和进行基因组整理成为可能。
---的blast服务器管理
一次设置多个blast服务器镜像，每次搜索时，选择zui好的一个。不用每次切换镜像。
ncbi blast云支持
有了ncbi blast云之后，设置您自己的blast镜像变得更为简单。如果您以这种方式创建一个镜像，geneious可以与它连接起来。
按索引连接
连接序列列表并按索引对齐，而不是按照名称对齐，这对于合并不---重叠的成对读取---有用。
序列列表的csv/tsv导出
将序列表中的所有序列连同它们的元数据一起导出到csv或tsv中，这样您就可以将它们放在excel中或类似的情况下进行进一步分析。
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